近年来，南京医科大学坚持教育援疆，学校发挥专业优势、学科优势，积极帮助新疆地区发展医学教育事业，为新疆培养本土的高层次医学专门人才，提供人才和科技支持。

学校通过合作成立研究中心、建设院士工作站、开展远程视频协助等多种方式加强人员和科学技术交流。学校第一临床医学院、第四临床医学院、儿科学院先后派出6批36位专家教授前往克州、伊犁州当地临床医院进行对口援助。36位专家均是学校重点优势学科的中坚力量，他们在新疆，发挥自身专业特长，传播先进医学理念和先进技术、进行临床教学指导，促进当地组建起门类齐备的临床医学、全科医学、康复医学等专业学科体系。今年8月13日，学校还与克州签约成立“柯尔克孜民族医药研究院”，将进一步整合学校科研优势和新疆地区民族医药的资源优势，共同致力于边疆地区民族医药的保护整理和研究利用。

截至今年，学校已累计为新疆地区培养临床医学、预防医学、医学影像学、全科医学、护理学等专业毕业生300多名，为新疆医学健康事业输送了一大批紧缺人才。学校第一临床医学院、口腔医学院等相关学院先后开展新疆地区卫生系统人才培训，目前已有百人次接受了医疗技术和卫生管理等方面的专业知识培训，逐步成长为地方卫生工作的骨干力量。学校先后组织500多人次短期专家博士团奔赴新疆开展讲座培训、健康宣教。